Question

как отличить корень с чередованием от проверяемого

Answer 1

Это придёт с опытом, а пока что могу посоветовать просто несколько раз изменить слово, чтобы понять с чередованием оно или нет.

Answer 2

корни с чередованием придется учить , а также и правила к ним. Если речь идет о гласной. Если о согласной - просто подобрать однокоренное слово с чередующейся согласной например: беГун -беЖать чередование г/ж