Question

всегда совпадают окончания в именительном падеже и винительном падеже Почему

Answer 1

Если ты имеешь ввиду имена существительные, то они не всегда совпадают. Например, в 1 склонении, в И.П вопросы кто? что? ( роза, дядя),  а в В.П вопросы кого? что? ( розу, дядю) 
Винительным падежом обозначается слово, которое является в предложении второстепенным членом. Если слово является главным членом предложения, то оно будет в форме именительного падежа!