Question

почему организм считают самостоятельной дискретной единицей биосферы?

Answer 1

Для простоты.
Можно рассматривать не организм, а симбиоз. Или вовсе био-геоценоз.
Можно рассматривать на уровне органов, клеток.
Но на уровне организма проще. Функции, значимые для решения проблем биосферы, локализуются как правило на уровне организма. Или во всяком случае проще формализуются.