Question

Почему низшие хордовые,дав начало разнообразным группам наиболее высоко организованных животных,сами так малочисленны?

Answer 1

Потому что в процессе эволюции низшие хордовые образовывали новые виды хордовых. Все хордовые начали еще более хорошо развиваться  и Высших хордовых становилось больше, а низших так и осталось маленькое количество. 
Каа-то так)))