Question

Почему церковь преследовала инакомыслие

Answer 1

Во-первых, было другое время. Время страшное, люди ни с чем и ни с кем не считались. Страшнейшие показательные казни - в Средневековой Европе это было нормально.

Во-вторых, церковь (а за ней и государства) хотели усилить своё влияние на мировой арене, добиться религиозной победы. Да и просто раньше чудовищный религиозный фанатизм, а в совокупности с первым фактором, у церкви были развязаны руки в своих делах и помышлениях.

Религиозные внешние войны были частым явлением в Европе, как, кстати, и внутренние стычки (та же Варфоломеевская ночь).